《环境系统研究方法》从介绍基本的科研规范入手，以科学研究的开展过程为主线，系统阐释环境系统研究的基本方法和技能。《环境系统研究方法》包括科学问题的凝练与表达、文献查阅与追踪、数据获取方式和途径、数据处理与分析、数据建模、数据可视化、数据不确定性和敏感性分析方法，以及科研论文的撰写和投稿。最后，《环境系统研究方法》还在附录中列出了科研项目申请书撰写和学术交流的基本规则和流程，从而使内容更加完善，具有更强的实用性。