《常见细菌与古菌系统分类鉴定手册》是在《常见细菌系统鉴定手册》基础上编写而成的。《常见细菌与古菌系统分类鉴定手册》分为两篇：**篇主要介绍了伯杰氏细菌分类系统、常见细菌和古菌的系统发育地位、属的描述、种的鉴别特征等；第二篇主要介绍了细菌和古菌的鉴定技术方法，包括常用的基本鉴定方法、细胞组成的化学分析技术、核酸分子技术和系统发育分析方法，以及自动化鉴定系统和菌种保藏方法。