本书共计十二个部分：导论部分介绍群体遗传学的内涵、发展状况等，第一章介绍自然突变率，第二章介绍 Hardy-Weinberg平衡定律应用，第三章介绍基因频率的定向变化，第四章介绍基因频率的随机变化，第五章介绍基因频率分布与进化过程，第六章介绍群体中的遗传变异，第七章介绍群体结构与系统分化，第八章介绍系统分类，第九章介绍 DNA与氨基酸序列的遗传演变，第十章介绍分子进化与“分子进化钟”，第十一章介绍动物遗传资源保种方案的制订。全书系统地总结了国际、国内这一研究领域的主要理论和研究成果，并与之配套提供了大量的数据分析和应用实例。动物群体遗传学作为从事动物遗传资源研究的基础理论知识以及相关软件的理论基础，将提供更为全面的遗传资源评价的理论和方法，为从事动物遗传相关研究的人士拓展视野，从而推动我国动物遗传资源事业和当代动物遗传资源科学的进一步发展。