明代朱儒所著《太医院志》及清代任锡庚所著《太医院志》，是仅存的两种关于明清两朝国家最高医药行政机构太医院的专门志书，有重要的史料价值。本书上、中篇分别对明、清《太医院志》进行校注和考证，同时与《明史》《清史稿》《明会典》《清会典》等历史文献中的有关内容进行互勘比照，辑集诸多方志、文集中的资料作为旁参，为深入研究二书提供了翔实材料。下篇以二书为中心，参考各种资料和研究成果，对明清两朝医药行政机构的沿革、制度、医官、著述和药材等情况进行专题探讨。