药用植物分子遗传学是研究药用植物遗传和变异规律的综合性学科。该学科通过研究药用植物性状和基因型的关系，从分子水平上研究药用植物基因的结构与功能、遗传与变异，揭示药用植物在生长发育和环境应答过程中遗传信息传递、表达和调控的分子机制，为药用植物资源的开发利用提供基础理论方法支撑。
　　本书是陈士林研究员及其带领的本草基因组学科研团队在药用植物遗传资源领域多年来探索、融合、创新性研究工作的总结。本书根据长期的研究经验提出了药用植物分子遗传学研究体系，对药用植物遗传资源的研究进行了细致的梳理和总结，对学科内容、研究理念、研究思路和应用前景进行了阐述。本书分为绪论、基础理论、实验技术和实践应用四部分，以理论体系、研究手段和经典案例作为各章节的展现模式。