本书分为四部分内容。第一部分介绍水生态系统和河流生态系统健康的概念与内涵，总结国内外水生态系统和河流生态系统健康评价方法及其研究进展。第二部分以济南市为研究区，构建不同生物指标的水生态系统健康评价指标体系。第三部分以北京市北运河流域为研究区，构建北京市北运河综合健康指数。第四部分以渭河流域为研究区，构建鱼类生物完整性健康评价指数，对渭河流域河流生态系统健康进行评价。三个研究区均具有较强的代表性，为全国范围内推广水生态系统和河流生态系统健康评价提供了参考和技术支撑。