本书分上下两篇，上篇为微生物工程原理及案例分析，包括绪论、工业微生物菌种选育、微生物基因工程、微生物发酵培养与来菌、微生物发酵过程及控制等内容；下篇为微生物工程典型产品案例，以更完整的案例阐述了与上篇对应的微生物工程原理及应用，包括氨基酸、有机酸、有机溶剂、核苷酸、维生素等方面的发酵生产原理及应用技术。